反滲透設備運行流程分三部分。一部分為反滲透設備的預處理部分，一部分為反滲透脫鹽處理部分，一部分為清洗部分。反滲透設備的預處理包括原水箱、石英砂過濾器、活性炭過濾器、陽離子交換器（或加藥阻垢裝置）、保安過濾器等。

預處理部分用于去除水中的懸浮物、膠體、鈣鎂離子等，以防止Ca、Mg、SiO2、Sr、Ba等物質在反滲透膜元件濃水側產生結垢，為后續的脫鹽處理提供條件；反滲透處理部分包括高壓泵、反滲透裝置，反滲透系統能脫除水中97%以上的鹽份，達到出水水質要求。

石英砂過濾器工作原理：

1、石英砂過濾器是利用石英砂濾料去除原水中的懸浮物，屬于普通快濾設備。 含有懸浮物顆粒的水流過砂濾器的濾料層時，濾料縫隙對懸浮物起篩濾作用使懸浮物易于截留在濾料表面。

2、當在濾料表層截留了一定量的污物形成濾膜，隨時間推移過濾器的前后壓差將會很快升高，直至失效。

3、此時需要利用逆向水流反洗濾料，使過濾器內石英砂層懸浮松動，從而使粘附于石英砂表面的截留物剝離并被水流帶走，恢復過濾功能。

活性炭過濾器工作原理

        活性碳過濾器主要是利用粒狀活性碳的吸附機理來吸附水中的有機物和余氯，還可以去除膠體渣、鐵化物、懸浮物，降低色度、濁度，保證后系統的正常運行，延長反滲透膜的使用壽命。

保安過濾器工藝原理：

利用PP濾芯10μm的孔隙進行機械過濾。水中殘存的微量懸浮顆粒、膠體、微生物等，被截留或吸附在濾芯表面和孔隙中。隨著制水時間的增長，濾芯因截留物的污染，運行阻力逐漸上升，當運行至進出口水壓差達0.1Mpa以上時，需要更換濾芯。

精密過濾器的主要優點是效率高、阻力小、便于更換。